分子是一種構成物質的粒子，呈電中性、由一個或多個原子組成，原子之間因共價鍵而鍵結^[1][2]。能夠單獨存在、保持物質的化學性質；由分子組成的物質叫分子化合物。

一個分子是由多個原子在共價鍵中通過共用電子連接一起而形成。它可以由相同的化學元素構成，如氧氣分子 O₂；也可以由不同的元素構成，如水分子 H₂O。若原子之間由非共價鍵的化學鍵（如離子鍵）所結合，一般不會視為是單一分子^[3]。

在不同的領域中，分子的定義也會有一點差異：在熱力學中，構成物質的分子（如水分子）、原子（如碳原子）、離子（如氯離子）等在熱力學上的表現性質都是一樣的，因此，都統稱為分子；在氣體動力論中，分子是指任何構成氣體的粒子，此定義下，單原子的惰性氣體也可視為是分子^[4]。而在量子物理、有機化學及生物化學中，多原子的離子（如硫酸根）也可以視為是一個分子。